Sanger sequencing

high quality precision analysis

>주요서비스>DNA Sequencing>Sanger sequencing>서비스 개요

바이오닉스의 sequencing service는 sanger method 방식의 high throughput DNA analyzer를 이용한 염기서열 분석서비스입니다.

DNA Sequencing Work Flow

주문접수 & 샘플 수거 홈페이지를 통한 분석 의뢰
서울 경기일부, 대전 : 직접수거
그 외 지역: 택배 및 우편접수
샘플 확인 수거된 샘플은 전기영동을 통해 농도 확인
(샘플 보관기간 : 2주)
Sequencing BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit을 이용한 PCR 진행
Bead 방식의 PCR product clean-up
Applied Biosystems 3730XL DNA Analyzer를 통한 running
결과 발송 홈페이지를 통한 결과 전달
SMS 문자발송
(Data 보관기간 : 1개월)

분석 요청한 샘플의 반환은 원칙적으로 진행하지 않습니다.
부득이한 사유로 샘플 반환을 원하시면 분석이 종료된 이후에 담당 영업사원 혹은 담당 부서에 연락 부탁드립니다.

Basic Sequencing

분석하고자 하는 DNA를 특정 primer를 이용하여 분석하는 서비스로서, Plasmid/PCR product와 같은 basic sample에 최적화되어 있습니다.

샘플 준비

샘플 준비
Sample 종류 Concentration Volume 비고
Plasmid 100~200 ng/ul 10 ul Vector backbone 이름 기재
PCR product (Purified) 50 ng~/ul 10 ul PCR product size 기재 필수
PCR product (Non-Purified) 50 ng~/ul 20 ul~ PCR product size 기재 필수
1 reaction 기준

Primer 준비

Primer 준비
Primer Concentration Volume 비고
Specific Primer 5 or 10 pmole/ul 10 ul Primer마다 각기 1.5ml tube에 준비
농도 기재 필수
Universal Primer 당사제공
(제공 Primer list에 없는 프라이머는 반드시 별도 동봉)
1 reaction 기준

Primer 보관 가이드라인

Primer 보관 가이드라인
최소기준 비고
Concentration Volume
5 pmol 100 ul 주 2회 이상 사용되는 Primer에 한해 보관서비스 가능
Stock primer의 보관도 가능하나, stability에 대해서는 보장하지 않음.
보관된 primer 내역은 1~3일내 확인 가능
Sequencing 주문창에서 보관된 Primer 바로 확인 가능

Universal Primer

Universal Primer
No Primer Name Sequence
1 ACYCDuetUP1 GGA TCT CGA CGC TCT CCC T
2 BGH-R CTA GAA GGC ACA GTC GAG GC
3 CMV24 TAT TAG GAC AAG GCT GGT GGG CAC
4 CMV30 AAT GTC GTA ATA ACC CCG CCC CGT TGA CGC
5 CMV-Forward CGC AAA TGG GCG GTA GGC GTG
6 DuetDown1 GAT TAT GCG GCC GTG TAC AA
7 DuetUP2 TTG TAC ACG GCC GCA TAA TC
8 EGFP-C CAT GGT CCT GCT GGA GTT CGT G
9 EGFP-N CGT CGC CGT CCA GCT CGA CCA G
10 GAL4(-BD)-3 TTT TCG TTT TAA AAC CTA AGA GT
11 GAL4(-BD)-5 TCA TCG GAA GAG AGT AGT
12 GL1 TGT ATC TTA TGG TAC TGT AAC TG
13 GL2 CTT TAT GTT TTT GGC GTC TTC CA
14 hU6 GAG GGC CTA TTT CCC ATG ATT
15 M13F(-20) GTA AAA CGA CGG CCA GT
16 M13F(-40) GTT TTC CCA GTC ACG AC
17 M13pUC-R GCG GAT AAC AAT TTC ACA CAG
18 M13R CAG GAA ACA GCT ATG AC
19 MATCHMAKER3 GTG AAC TTG CGG GGT TTT TCA GTA TCT ACG AT
20 MATCHMAKER5 GAA GAT ACC CCA CCA AAC
21 mCherry-F CCC CGT AAT GCA GAA GAA GA
22 mCherry-R TTG GTC ACC TTC AGC TTG G
23 pBad-F ATG CCA TAG CAT TTT TAT CC
24 pBad-R GAT TTA ATC TGT ATC AGG
25 pET-upstream ATG CGT CCG GCG TAG AGG
26 pFastBac-F GGA TTA TTC ATA CCG TCC CA
27 pFastBac-R CAA ATG TGG TAT GGC TGA TT
28 pGEX3 CCG GGA GCT GCA TGT GTC AGA GG
29 pGEX5 GGG CTG GCA AGC CAC GTT TGG TG
30 pJET1.2-F CGA CTC ACT ATA GGG AGA GCG GC
31 pJET1.2-R AAG AAC ATC GAT TTT CCA TGG CAG
32 pMAL-F AAC ATC CCG CAG ATG TCC
33 pMAL-R CAA GCT GCC ATT CGC CAT
34 pQE-forward CCC GAA AAG TGC CAC CTG
35 pQE-reverse GTT CTG AGG TCA TTA CTG G
36 RV3 CTA GCA AAA TAG GCT GTC CC
37 RV4 GAC GAT AGT CAT GCC CCG CG
38 SP6 ATT TAG GTG ACA CTA TAG
39 SV40 pAR GAA ATT TGT GAT GCT ATT GC
40 T3 CAA TTA ACC CTC ACT AAA
41 T7 TAA TAC GAC TCA CTA TAG GG
42 T7terminator GCT AGT TAT TGC TCA GCG G
43 U6 CAG TGC AGG GGA AAG AAT AGT AGA C
44 U6pro GGG CAG GAA GAG GGC CTA T

미생물 동정 관련 Primer

세균동정 27F AGA GTT TGA TCM TGG CTC AG
1492R GGT TAC CTT GTT ACG ACT T
518F CCA GCA GCC GCG GTA ATA CG
800R TAC CAG GGT ATC TAA TCC
진균동정 ITS1 TCC GTA GGT GAA CCT GCG G
ITS4 TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC
NL1 GCA TAT CAA TAA GCG GAG GAA AAG
NL4 GGT CCG TGT TTC AAG ACG G
LROR ACC CGC TGA ACT TAA GC
LR7 TAC TAC CAC CAA GAT CT
NS1 GTA GTC ATA TGC TTG TCT C
NS8 TCC GCA GGT TCA CCT AC GGA

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