Microbial Identification
세균 및 진균류의 유전자 보존 영역인 16s 및 18s, 25~28s rRNA와 ITS (Internal transcribed spacer) 부위의 염기서열을 ‘Sanger method’ 방식으로 분석하여 균주 동정 (Microbial identification) 결과를 제공하는 서비스 입니다. 해당 보존 부위를 분석 할 수 있는 사전 개발된 PCR 방식을 활용하며, 균주동정, 계통발생, 계통분류 등에 활용 하실 수 있습니다.
샘플 준비
순수 배양한 colony 형태(Bacteria, Fungal Strain)
(Genomic DNA)
분석과정
Genomic DNA Extraction |
Chelex resin를 사용하여 boiling |
PCR Amplification |
Gene specific primer를 사용한 PCR 증폭 |
PCR Product Cleanup |
ExoSAP을 이용한 PCR product cleanup 진행 |
세균동정
Bacteria gDNA를 이용하여 16s rRNA PCR 진행 (27F-1492R)
약 1.5kb의 PCR product가 생성되며 이를 정제후 sequencing을 진행
요청에 따라inernal primer로 추가 분석 가능
진균동정
Unknown
세가지 specific primer를 이용하여 PCR 진행(27F+1492R/ITS1+ITS4/NL1+NL4)