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DNA oligo synthesis

바이오닉스사는 1998년 Oligo synthesis service를 시작한 이래, 최신 설비와 노하우를 바탕으로 고품질 DNA Oligonucleotide를 생산/공급하고 있습니다. 특히 Global Oligo 제조공급사인 BIOBASIC®사로부터 지속적인 신규 장비와 기술을 도입하여 그 품질 향상을 도모하고 있으며, 이를 기반으로 업계 최고 수준의 품질을 자랑하는 Oligo와 Gene synthesis service 제공하고 있습니다.

  • High quality & Cost effective
  • Wide range of synthesis scales from 25 nmol to 1 μmole
  • Synthesis available up to 130 mer
  • Various purification options : HAP, HPLC, PAGE
  • Various modified oligos and probes
  • 100% all product QC by LC mass spectrometry

Oligo Modifications list

Modification (Mod.) Name 5' Mod. 3' Mod. Internal Mod.
Acrydite
Aldehyde Modifier (CHO)
Alkyne Modifier
Amino Modifier - NH2 C12
Amino Modifier - NH2 C6
Amino Modifier - NH2 C6 dT
Amino Modifier - NH2 C7
Azide Modifier
Biotin
Biotin dT
Biotin-TEG
Dual Biotin
Desthio Biotin-TEG
Carboxy Modifier (C00H)
Digoxigenin dT
Digoxigenin NHS Ester
Dithiol
Ferrocene Modifier
Thiol Modifier C3 SH
Thiol Modifier C3 S-S
Thiol Modifier C6 SH
Thiol Modifier C6 S-S
Modification (Mod.) Name 5' Mod. 3' Mod. Internal Mod.
BHQ-1
BHQ-1 dT
BHQ-2
BHQ-2 dT
BHQ-3
Dabcyl
Dabcyl dT
Dabcyl NHS Ester
Eclipse
Modification (Mod.) Name 5' Mod. 3' Mod. Internal Mod.
6-FAM
6-FAM dT
Alexa Fluor 488
AMCA
CY3
CY5 dT
CY5 NHS Ester
CY5.5
DBCO
HEX
JOE NHS Ester
Methylene Blue
ROX NHS Ester
TAMRA dT
TAMRA NHS Ester
TET
Texas Red
Modification (Mod.) Name 5' Mod. 3' Mod. Internal Mod.
Dideoxy-A (ddC)
Dideoxy-C (ddC)
Dideoxy-G (ddC)
Dideoxy-T (ddC)
2-Aminopurine
2F-RNA Modifier
2'-O-Methyl
5-Aza-2'-deoxycytidine
5-Bromo dU
8-OXO-dA
8-OXO-dG
DeoxyInosine dI
DeoxyUridine dU
Inverted dA
Inverted dC
Inverted dG
Inverted dT
Phosphorothioate Bond
Pyrrolo-dC
XNA Modifier - backbone mod.
Modification (Mod.) Name 5' Mod. 3' Mod. Internal Mod.
Phosphorylation
Modification (Mod.) Name 5' Mod. 3' Mod. Internal Mod.
C3 Spacer
C6 Spacer
dSpacer
PC Linker
Spacer 18
Spacer 9
Modification (Mod.) Name 5' Mod. 3' Mod. Internal Mod.
6-FAM & BHQ-1 6-FAM BHQ-1
6-FAM & BHQ-1 dT 6-FAM BHQ-1 dT
6-FAM & Eclipse 6-FAM Eclipse
6-FAM & TAMRA NHS Ester 6-FAM TAMRA NHS Ester
CY3 NHS Ester & BHQ-2 CY3 NHS Ester BHQ-2
CY3 NHS Ester & BHQ-3 CY3 NHS Ester BHQ-3
CY5.5 NHS Ester & BHQ-2 CY3 NHS Ester BHQ-2
CY5.5 NHS Ester & BHQ-3 CY3 NHS Ester BHQ-3
HEX & BHQ-1 CY3 NHS Ester BHQ-1
HEX & BHQ-1 dT HEX BHQ-1 dT
HEX & Eclipse 6-FAM Eclipse
HEX & TAMRA NHS Ester HEX TAMRA NHS Ester
JOE NHS Ester & BHQ-1 JOE NHS Ester BHQ-1
JOE NHS Ester & BHQ-2 JOE NHS Ester BHQ-2
ROX NHS Ester & BHQ-2 ROX NHS Ester BHQ-2
ROX NHS Ester & Eclipse ROX NHS Ester Eclipse
TAMRA NHS Ester & BHQ-2 TAMRA NHS Ester BHQ-2
TAMRA NHS Ester & Eclipse TAMRA NHS Ester Eclipse
TET & BHQ-2 TET BHQ-2
TET & TAMRA NHS Ester TET TAMRA NHS Ester
Texas Red & BHQ-2 Texas Red BHQ-2
Modification (Mod.) Name 5' Mod. 3' Mod. Internal Mod.
6-FAM & Dabcyl Texas Red Dabcyl
CY3 & Dabcyl CY3 Dabcyl
CY5 & Dabcyl CY5 Dabcyl
HEX & Dabcyl HEX Dabcyl
JOE & Dabcyl JOE Dabcyl
ROX & Dabcyl ROX Dabcyl
TAMRA NHS Ester & Dabcyl TAMRA NHS Ester Dabcyl
TET & Dabcyl TET Dabcyl
Texas Red & Dabcyl Texas Red Dabcyl

*Special Service
바이오닉스만의 경쟁력으로 보다 저렴한 가격으로 고퀼리티의 oligo를 제공하고자 다음과 같은 special service를 실시하고 있습니다

1 week Oligo
납품기간 1주일 (Business day기준)
합성사이즈 16~29mer
합성스케일 25nmole (2 OD보장)
정제 HAP 기본정제
가격 190원 / mer

FAQ

Oligo 보관법 및 사용방법
Oligo 는 일반적으로 Dry 된 형태로 공급됩니다.
처음 올리고를 받으시고 뚜껑을 여시기 전 먼저 Centrifuge 에 잠시 돌리신 후 뚜껑을 열어주십시오.
제품을 수령하신 후 용기에 기재된 양의 TE buffer (10 mM Tri-HCl pH8.0, 1 mM EDTA) 또는 멸균증류수에 녹여 100 uM stock 상태로 -20℃이하에 보관하시고,
사용시 적정 농도로 희석하여 사용하시기를 권장합니다.
용액상태로 보관할 때에는 멸균증류수에 녹이는 것보다 TE (10mM Tri-HCl (pH8.0), 0.1mM EDTA) Buffer 에 녹여두시면 더 오래 보관할 수 있습니다.
만약 올리고가 잘 녹지 않을 경우 60~70℃ water bath 에 10~15 분간 incubation 시킨 후 vortex 하여 centrifuge 후에 사용하시기 바랍니다.
올리고의 O.D. 값은 무엇을 의미하나요?
합성 올리고는 매우 미량이라 어느 정도의 양이 있는지 무게를 재서 알아내기는 매우 힘듭니다. 따라서 올리고의 빛의
흡광도를 측정하여 간접적으로 합성 올리고의 정량을 하게 되는데 이때 빛의 흡수량을 O.D. (Optical density) 값으로 표시합니다.
합성된 올리고의 농도 맞추는 방법에 대한 설명.
우선 올리고 합성 시트에 쓰여있는 'volume for 100 pmole/ul' 라는 말은 100 pmole/ul 의 농도로 만들기 위해 첨가해야 할
TE buffer 나 D.W 의 양을 이야기 합니다. 받으신 리포트용지에 각각 189.0 과 209.2 라고 적혔다면, 각 oligomer tube 에 적힌 대로 각각 D.W 등을 189.0 ul 와 209.2 ul 를 각각 첨가했을 때 농도가 100 pmole/ul 가 된다는 것입니다.
합성 올리고의 분자량 (Molecular Weight) 측정은 어떻게 하나요?
다음의 수식에 각 base 의 수를 대입하여 계산합니다.
M.W. =(NA x 249.2) + (NC x 225.2) + (NG x 265.2) + (NT x 240.2) + (oligolength-1) x 63.98) + 2.02
NA = Total number of A
NC = Total number of C
NG = Total number of G
NT = Total number of T
50 nmoles scale로 주문했는데 합성량이 그 보다 적은 이유는?
50 nmole scale 합성은 최종 올리고의 양이 50 nmole 이 된다는 것이 아니라 합성 출발물질의 양을 50 nmole 로 하여 합성을
시작한다는 것을 의미합니다. 따라서 합성 및 정제된 최종 올리고의 양은 올리고의 길이, 합성효율(coupling efficiency, 보통 >98%), 염기조성 등에 따라 변하게 됩니다.